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国际首例一串红基因图谱公布

导读

由北京市园林科学院和北京林业大学科研人员完成的《重要观赏植物一串红的高质量参考基因组组装》论文,在牛津大学出版社的权威刊物《大数据科学》(Gigascience)在线发表。这是一串红基因图谱国际首发,对唇形科植物的研究、育种具有重要意义。“……

由北京市园林科学院和北京林业大学科研人员完成的《重要观赏植物一串红的高质量参考基因组组装》论文,在牛津大学出书社的权威刊物《大数一串红基因研究项目选择国旗红色‘奥运圣火’的2个单株举行了分子测序(PacBio Single-Molecule Real-Time,SMRT),得到了808M的一串红高质量全基因组序列。以contigs和scaffolds(2个基因组序列片断)长度漫衍为评价指标,一串红和已报道的薄荷,以及2个丹参基因组举行了比较,效果解释,本次研究中得到的一串红基因组质量远高于其他2类唇形科植物。毛建丰介绍说,本次能得到高质量的基因图谱,下午之一是选种,‘奥运圣火’是一个自交品种,它的两套基因序列平等,提高了基因组合排列的正确性,而这其中园科院在一串红领域30多年的研究经验非常重要,‘奥运圣火’自己也是园科院的自育品种。

一串红曾普遍应用于花坛、景观,但近年来应用有下滑趋势,此次基因图谱的公布,有助于一串红的快速育种,或将打开一串红应用的“第二春”。在其他唇形科花卉方面,利用一串红的基因谱图,除了研究花色和抗性相关基因,还可以发现药用、精油等有用因素的合成调控机制,对培育多用途的唇形科新品种提供了新的可能。

本项目自2021年11月开始,今年6月19日论文正式在线上公布。北京市园林科学研究院教授级高工董爱香博士、高级工程师辛海波博士、高级工程师李子敬博士为论文的配合第一作者,北京市园林科学研究院副院长、绿化植物育种北京市重点实验室主任、教授级高工丛日晨博士和北京林业大学林木分子设计育种高精尖创新中心副教授毛建丰为本论文的配合通讯作者。

国际首例一串红基因图谱公布

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