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“毛竹基因组测序研究”通过国度林业局验收

导读

毛竹是天下上最重要的木本竹之一,具有重要的生态和经济代价,在山区脱贫致富中发挥着重要浸染......……

7月11日,林业公益性行业科研专项重大项目“毛竹基因组测序研究”通过国度林业局验收。项目由国际竹藤中心主任江泽慧主持,中国林科院、国际竹藤中心和中国科学院国度基因研究中心3家单位配合完成。

毛竹是天下上最重要的木本竹之一,具有重要的生态和经济代价,在山区脱贫致富中发挥着重要浸染,全球每年竹产品国际商业额近20亿美元。毛竹全基因组测序工作的完成,填补了禾本科植物竹亚科基因组的空缺,将对包罗竹类植物在内的一系列重要物种的基因成果、分子育种、物种进化及其他相关规模的研究发生敦促浸染。这项研究由我国科研人员自主完成。

项目回收第一代测序技能和第二代高通量测序技能相团结的计策,得到了毛竹2.05Gb基因组草图,包围毛竹全基因组的95%,预测出31987个高度靠得住性的基因,成就于2021年2月24日颁发在国际权威杂志《NatureGenetics》上。这是截至研究成就颁发时,天下上利用第二代测序要领测定的、布局最为巨大的高档植物基因组之一。

项目操作较量基因组学要领,通过对多物种的直系同源基因家属的聚类与进化阐明,首次阐发了毛竹于5000万年前从禾本科植物中分化出来,继而于12021年前形成了四倍体,最后演酿成现代二倍体毛竹的进化汗青。同时,展现出二穗短柄草比水稻与毛竹的亲缘干系更近。项目组构建了毛竹不同器官、不同发育时期材料的全长cDNA文库,并测序组装得到了10608条全长cDNA序列和约38000条EST序列。成立了包罗毛竹开花时期等多范例材料的基因表达谱,首次从基因组层面临包罗快速生长和开花调控在内的毛竹非凡生理进程的形成和机理举办了阐明。

项目成立了天下上第一个竹子基因组阐明与注释数据库,提供了较量基因组、卵白-卵白互作、代谢通路和组学信息可视化阐明东西,对促进竹类植物研究具有重要代价。

由9位院士专家构成的验收委员会平等同意通过验收,认为项目成就为毛竹及其他竹类植物的生物学研究奠基了坚硬基本,具有重要的科学代价和应用前景。

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